今天发现这个事，试着解决了一下。

微软官方文档 https://docs.microsoft.com/en-us/sharepoint/delete-site-collection

假设你的旧域名是 https://old.sharepoint.com/ 新域名是 https://new.sharepoint.com/

先还原已删除的网站。然后再

Remove-SPODeletedSite -Identity https://old.sharepoint.com/sites/sitetoremove

一定要先还原，并且用旧域名删除。